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基因数据处理20之BWASW算法ref分块建立索引然后比对
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:125
SRR003161h20.fastq span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: 12px; background-color: rgb(255,255,255);"三次测试:/span hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub$ bwa bwasw GRCH38chr1L3556522.fna SRR003161h20.fa[详细]
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基因数据处理21之BWASW算法ref分块建立索引然后比对(ref切分为
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:110
副标题#e# 1.时间分析 对ref为单条染色体进行比对,第一次比对在3-5s不等,对chr1-4比对,在20s左右 连续比对多次后,对单染色体比对降到1s左右,chr1-4降到2s左右 不懂为什么比一次比对时间比较长,后面几次比对时间变短 运行代码: hadoop@Master:~/cloud[详细]
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基因数据处理22之对GRCH38全基因建立BWA索引
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:90
副标题#e# 环境: ubuntu 14.04 内存 6G bwa 0.7.12 结论: 建立索引大概4500秒左右 节点2运行: hadoop@Mcnode2:~/cloud/adam/xubo/data/test20160422$ cp ../test20160310/GCA_000001405.15_GRCh38/GCA_000001405.15_GRCh38_full_analysis_set.fna .hadoo[详细]
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产品策略研究期的数据分析与挖掘
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:131
副标题#e# 万物生长,适者生存,事物发展代谢遵循一定趋势,产品亦然。 策略研究找趋势 在产品设计阶段,第一时期策略研究首先从宏观角度对外部环境和内部情况加以分析,重点关注市[详细]
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基因数据处理23之BWASW算法ref分块建立索引然后比对(ref切分为
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:183
结论: read为25000条对单条染色体进行比对需要110秒左右,对chr1-4比对需要160秒左右 运行结果: 1[M::bwa_idx_load_from_disk] read 0 ALT contigs[bsw2_aln] read 17040 sequences/pairs (10000385 bp) ...[bsw2_aln] read 7960 sequences/pairs (44696[详细]
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NJUST 1926 琪露诺的算术教室 (解方程 大数)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:83
琪露诺的算术教室 Time Limit: 1000ms Memory Limit: 65536KB Description 给出一个非负整数A,将这个数字的最低位移动到最高位(原来的最高位变为次高位,次低位变成最低位),得到非负整数B,发现B恰好是A的k倍。现给出A的最低位的值n,和倍数k,求最小[详细]
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【bzoj4542】[Hnoi2016]大数 莫队
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:162
Description 小 B 有一个很大的数 S,长度达到了 N 位;这个数可以看成是一个串,它可能有前导 0,例如00009312345 。小B还有一个素数P。现在,小 B 提出了 M 个询问,每个询问求 S 的一个子串中有多少子串是 P 的倍数(0 也 是P 的倍数)。例如 S为0077时[详细]
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大数据分析公众号阅读量10万+文章标题里的秘密!
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:67
副标题#e# 来源:数据种子(ID:wujiedata) 作者:无解新闻记者 杨佳 在微信公众号每天推送的文章汪洋里,有哪些文章可以突破十万+,登上热门榜,从此走上文生巅峰呢? 为了解开这个千古难题,我们收集了近三个月(9-11月)的微信公众号原创内容榜单,包括[详细]
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[bzoj4542][HNOI2016]大数
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:111
题目大意 给定字符串 每次询问该字符串的一个子串中有多少子串转为数字后是p的倍数。 p10^10且是质数,每次询问p相同。 式子转化 如果对[l,r]询问那么答案相当于 ∑ri=l∑rj=i(∑jk=is[k]?10j?kmodp==0) ∑ri=l∑rj=i(10j?∑jk=is[k]?(10′)kmodp==0) 其中[详细]
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[汇编学习笔记][第八章数据处理的两个基本问题]
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:179
第八章 数据处理的两个基本问题 本章对前面具有总结性。主要解决以下两个问题 处理的数据在什么地方 要处理的数据有多长 定义描述符号reg和sreg reg:ax,bx,cx,dx,ah,al,bh,bl,ch,cl,dh,dl,sp,bp,si,di; sreg:ds,ss,cs,es。 8.1 bx,di和bp 在8086CPU中,只[详细]
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NYOJ-517-最小公倍数,大数啊~~~
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:153
最小公倍数 时间限制: 1000?ms ?|? 内存限制: 65535?KB 难度: 3 描述 为什么1小时有60分钟,而不是100分钟呢?这是历史上的习惯导致。但也并非纯粹的偶然:60是个优秀的数字,它的因子比较多。事实上,它是1至6的每个数字的倍数。即1,2,3,4,5,6都是可以[详细]
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bzoj 4542: [Hnoi2016]大数
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:184
在p!=2且p!=5的情况下,x*10^k%p=0,则x%p=0,所以可以维护后缀和%p的值,然后用莫队求区间内相同的数的对数。 p=2 or p=5 最后一位决定%p之后的值,yy一下即可 #includecstdio#includecstdlib#includecstring#includealgorithm#includemap#includecmath#def[详细]
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BZOJ4542: [Hnoi2016]大数
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:197
省选2016系列…HNOI2016… 考虑s[i]表示i这个前缀在%p意义下是多少,那么如果一个字串%p为0当且仅当:s[i]=s[j]*po[i-j] (j i)。po[i]表示(10^i)%p。 看起来这个式子不好弄,因为p是素数,那么如果10有逆元的话,我们可以把式子写成这样:s[i]/po[i]=s[j]/[详细]
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IBM领先大数据分析课程登陆“好大学在线”慕课平台 携手上海交大
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:137
副标题#e# 近日,IBM大数据大学与上海交通大学慕课学院签署了合作备忘录,宣布IBM大数据大学专区已经正式登陆“好大学在线”慕课平台。同时,IBM大学合作项目还向校方捐赠了价值100万美元的大数据分析软件,以全面支持其建设大数据分析实验室,并结合“好大[详细]
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BI的架构模型
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-15 热度:191
数据仓库的架构模型包括了星型架构与雪花型架构两种模式 如图所示,星型架构的中间为事实表,四周为维度表,类似星星; 而相比较而言,雪花型架构的中间为事实表,两边的维度表可以再有其关联子表,从而表达了清晰的维度层次关系。 从OLAP系统的分析需求和[详细]
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【BZOJ3110】【codevs1616】K大数查询,权值线段树套普通线段树
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-19 热度:126
Time:2016.05.09 Author:xiaoyimi 转载注明出处谢谢 传送门1 传送门2 思路: 之前没怎么接触过权值线段树(非主席树),这次就当学习了一下吧。一开始还把题意理解错了,我的天[详细]
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poj1503 Integer Inquiry (大数相加)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-19 热度:137
C - Integer Inquiry Crawling in process... Crawling failed Time Limit:1000MS???? Memory Limit:10000KB???? 64bit IO Format:%I64d %I64u Submit Status Practice POJ 1503 Appoint description: System Crawler (2016-05-09) Description One of the[详细]
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大数据处理的一些总结和应用(有关舆情监控)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-18 热度:170
? ? 说到大数据处理可能大家都不会陌生,这是近年来非常火热的话题,各行各业都想借助大数据为自己助力,有了这个工具,就好像在飞机上看农田一般清晰,一目了然,也也就是业内人士常说的大数据提供了一个------上帝视角 大数据的概念: 1、指的是所涉及的[详细]
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余弦相似性:找出相似文章
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-18 热度:148
上一次,我用TF-IDF算法自动提取关键词。 今天,我们再来研究另一个相关的问题。有些时候,除了找到关键词,我们还希望找到与原文章相似的其他文章。比如,"Google新闻"在主新闻下方,还提供多条相似的新闻。 为了找出相似的文章,需要用到"余弦相似性"(c[详细]
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bzoj 3110: [Zjoi2013]K大数查询(树套树,整体二分)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-18 热度:144
副标题#e# 3110: [Zjoi2013]K大数查询 Time Limit:?20 Sec?? Memory Limit:?512 MB Submit:?4020?? Solved:?1547 [ Submit][ Status][ Discuss] Description 有N个位置,M个操作。操作有两种,每次操作如果是1 a b c的形式表示在第a个位置到第b个位置,每个[详细]
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数据流和批量大数据分析技术 Apache Apex 提升为 Apache 顶级项
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-18 热度:136
数据流和批量大数据分析技术Apache Apex近日被Apache软件基金会提升为顶级项目。这项技术已被包括第一资本(Capital One)和通用电气(GE)在内的企业组织使用,可以帮助开发人员更快速地创建充分利用实时数据的应用程序。 Apache Spark日益受到关注,表明[详细]
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大数加法运算
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-18 热度:83
void add(char a[],char b[]){/*********************装换*********************/int num1[LEN];int num2[LEN];for (int i = 0; i LEN; i++){num1[i] = 0;num2[i] = 0;}int lena = strlen(a);int lenb = strlen(b);for (int i = lena - 1,j = 0; i = 0; i-[详细]
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图像相似性搜索的原理
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-18 热度:75
副标题#e# 本文转自: http://www.hackerfactor.com/blog/index.php?/archives/432-Looks-Like-It.html http://www.voidcn.com/article/p-nvcdxgfv-bnx.html http://blog.sina.com.cn/s/blog_b27f71160101gp9c.html http://www.voidcn.com/article/p-ojqegj[详细]
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大数整除(大数mod)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-18 热度:59
Description 定理:把一个至少两位的正整数的个位数字去掉,再从余下的数中减去个位数的5倍。当且仅当差是17的倍数时,原数也是17的倍数 。 例如,34是17的倍数,因为3-20=-17是17的倍数;201不是17的倍数,因为20-5=15不是17的倍数。输入一个正整数 n ,[详细]
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FZU- Problem 1147 Tiling,递推坑题,大数水过~~
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-18 热度:124
副标题#e# Problem 1147 Tiling Time Limit: 1000 mSec?? ??Memory Limit : 32768 KB http://acm.fzu.edu.cn/problem.php?pid=1147 ?Problem Description In how many ways can you tile a 2x n ?rectangle by 2x1 or 2x2 tiles? Here is a sample tiling o[详细]
